DNAシークエンサー
機種：ABI PRISM 3130xl Genetic Analyzer
設置場所：306
備考： キャピラリーDNAシークエンサー3130xl予約ルール（2013年10月23日より運用）

予約は1人1回まで。1回の利用は連続した２枠（６時間）まで。
（シークエンサーの利用が終了してから次の予約を入れるようにして下さい）

（2022年12月23日）
DNAシークエンサーの夜間枠（午後9時〜午前9時）を有効に活用していただくため、通常の予約（1人1回、1回は連続2枠まで）に加えて、21:00〜09:00の4枠の予約を以下のように可能とします。

21:00〜09:00（午後9時〜午前9時）の4枠については、前日の09:00（午前9時）以降に自由に予約可能とする。（通常の予約に加えて予約可能）

（例）12月23日の09:00（午前9時）以降に、12月24日21:00〜12月25日09:00の4枠を自由に予約することができる。
3130xl使用マニュアル

3130xlの使用方法を説明したマニュアルです。オンライン機器使用予約のユーザー名とパスワードでご覧ください。

3130xl使用マニュアル（2022.9.29改訂：Windowsはshut downしない）
3130xl Operation Manual (English)  (Revised 2022.9.29. Do NOT shut down Windows)

＜機器添付の説明書類＞
操作ガイド
BigDye Terminator v1.1プロトコール
BigDye Terminator v3.1プロトコール
ユーザーガイド
Sequencing Analysis
マイクロサテライト
ユーザーブリテン FAQ KB Basecaller
GeneMapper Ver4
サンプルのセットに関する諸注意

予定運転時間オーバーやキャピラリー破損を防ぐための注意点をまとめました。参照して下さい。

サンプルセットの注意点

その他のお願い
  1. 利用中止が決まったらなるべく早く予約をキャンセルして下さい。空いた枠を他の人が利用できるよう、必ず予約表のキャンセルをお願いします。

  2. 予約枠に合わせた利用をお願いします。2枠予約をしていながら、1回しか利用していないケースも見受けられます。なるべく多くの人が利用できるよう、開始時間を守って枠をまたぐ使用はしないで下さい。

  3. 大量サンプル解析のため連続して3枠以上の運転が必要な場合には、遺伝子機能教員にご相談下さい。
多くの予約をまとめて入れる人が現れ、他の人が予約できずに困る事態が発生しています。予約のまとめ取りによる弊害をなくすため、今回ルールを設けました。
マルチキャピラリーDNAシークエンサーは多くの人に利用されている共通機器です。
なるべく多くの人が待ち時間なく利用できるよう、適切な予約をお願いします。

50 cm キャピラリー（16本）、POP7で運用しています。（他の長さのキャピラリー、他のポリマーでの運用は行いません）
＜Sequence解析＞：BigDye Terminator v1.1、BigDye Terminator v3.1を使用して下記のシークエンスが可能です。

　通常（BigDye XTerminator Purification Kitを使用せずに、従来の方法でサンプル調製を行った場合）のInstrumental Protocol

Instrumental Protocol （BigDye XTerminator Purification Kit使用しない従来のサンプル調製）
FastSeq50_POP7_BDTv1：BigDye Terminator v1.1で反応を行ったサンプルを用いてFast Sequence.
FastSeq50_POP7_BDTv3：BigDye Terminator v3.1で反応を行ったサンプルを用いてFast Sequence.
StdSeq50_POP7_BDTv1：BigDye Terminator v1.1で反応を行ったサンプルを用いてStandard Sequence.
StdSeq50_POP7_BDTv3：BigDye Terminator v3.1で反応を行ったサンプルを用いてStandard Sequence.


　BigDye XTerminator Purification Kitを用いて調製したサンプルのInstrumental Protocol

Instrumental Protocol （BigDye XTerminator Purification Kitでサンプル調製）
BDx_FastSeq50_POP7_V1：BigDye Terminator v1.1で反応を行ったサンプルを用いてFast Sequence.
BDx_FastSeq50_POP7_V3：BigDye Terminator v3.1で反応を行ったサンプルを用いてFast Sequence.
BDx_StdtSeq50_POP7_V1：BigDye Terminator v1.1で反応を行ったサンプルを用いてStandard Sequence.
BDx_StdtSeq50_POP7_V3：BigDye Terminator v3.1で反応を行ったサンプルを用いてStandard Sequence.


＜Fragment解析＞：下記のInstrumental Protocolが使用できます。GeneMapperがインストールされています。

fragmentD (Dye Set D)
fragmentE5 (Dye Set E5)
fragmentF (Dye Set F)
fragmentG5 (Dye Set G5)

2017年11月2日（木）21:00（使用簿10023）～2017年11月29日午前の運転におけるファイル名とデータのずれ

図による説明
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担当者：中川強     
DNAシークエンサー
 
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